Madaling ikuwento ang agham bilang isang malinis na paghihiwalay mula sa relihiyon. Pinapalitan ng Enlightenment ang pamahiin, pinapalitan ng obserbasyon ang pananampalataya, pinapalitan ng katuwiran ang awtoridad. Maayos itong pakinggan, at pinapaganda nito ang mga modernong palagay. Ngunit may nalalaktawan itong mas kawili-wili at, sa totoo lang, mas hindi komportable para sa kuwentong iyon: ang ideya na ang sansinukob ay nauunawaan sa unang lugar ay hindi maliwanag sa sarili nito. Ito ay isang metapisikal na pahayag. At ang Katolikong monoteismo ay isa sa mga pangunahing makasaysayang dahilan kaya nagmukhang makatuwiran ang pahayag na iyon.
Sa isang tunay na paganong mundo, ang kalikasan ay hindi lamang basta “kalikasan.” Ito ay matao. May mga espiritu ang mga ilog. May mga kapritso ang panahon. May mga presensya ang mga kagubatan. Ang sakit ay maaaring pagpapahayag ng galit, pakikipagkasundo, kawalan ng balanse, o nag-uunahang hindi nakikitang mga puwersa. Ang mundo ay hindi iisang magkakaugnay na sistema kundi isang nagkakapatong-patong na negosasyon sa pagitan ng mga kapangyarihang may layunin. Isang mundo kung saan kailangan mong manalangin sa maraming diyos at espiritu para matiyak na sang-ayon sila sa iyong presensya at mga layunin. Sa ganoong kapaligiran, hindi neutral ang eksperimentasyon. Mapanganib ito sa ibang kahulugan, dahil hindi ipinapalagay na matatag ang mga resulta. Nakadepende ang mga ito sa kalooban, hindi lamang sa mga kondisyon.
Hindi ito nangangahulugang walang kakayahan ang mga kulturang bago dumating ang Kristiyanismo sa obserbasyon o praktikal na kaalaman. Malinaw na may kakayahan sila. Ngunit ang totoo, ang mga Griyego, Romano, Ehipsiyo... na nagtataguyod ng isang makatuwirang sansinukob ay lahat nagsimulang magsama-sama tungo sa pantheism (ang buong sansinukob ay DIYOS at bahagi tayo nito) o monoteismo (iisa lamang ang Diyos, at ang sansinukob ay makatuwiran at pinamamahalaan ayon sa mga batas) . Ngunit iba ang intelektuwal na saloobin tungo sa kalikasan kapag ang kalikasan ay isa ring panlipunang espasyong puno ng mga ahenteng maaaring tumugon sa iyo.
Nagpakilala ang Katolikong monoteismo ng isang ibang-ibang palagay: may isang Lumikha, at ang nilikha mismo ay hindi banal, hindi dapat sambahin. Ang kalikasan ay hindi isang konseho ng nag-uunahang kalooban. Hindi ito moral na nahahati-hati sa antas ng pisikal na sanhi. Pinag-iisa ito sa ilalim ng iisang pinagmumulan ng kaayusan. Hindi nito ginagawang simple ang kalikasan, at tiyak na hindi nito ito ginagawang transparent, ngunit ginagawa nga nitong magkakaugnay ito.
At ang pagkakaugnay ay isang nakalimutang kinakailangan para sa agham. Itinuturing natin itong karaniwan, ngunit hindi laging nakita ang mundo bilang pinamamahalaan ng mga batas (pisikal, moral o anumang uri), kundi sa halip ng nag-uunahang kalooban ng iba't ibang espiritu at diyos.
Makapagsisimula ka lamang magtiwala sa sistematikong pagsisiyasat kung naniniwala kang ang paulit-ulit na obserbasyon ay talagang magsasama-sama tungo sa isang bagay na matatag. Kung ang realidad ay pundamental na pinamamahalaan ng nag-uunahang layunin, kung gayon ay hindi mangyayari ang konsistensiya, lahat ay tungkol sa kalooban at damdamin ng mga diyos. Kung ang realidad ay pinamamahalaan ng iisang makatuwirang pinagmumulan, kung gayon ay nagiging inaasahan ang konsistensiya, kahit nananatiling nakatago ang mga detalye. KUNG may inilagay na sistema, anuman ang inaakala nating paglikha nito sa simula, kung gayon ay maaaring pag-aralan ang sistema mula sa loob, o kahit pangatuwiranan man lamang. Maaaring hindi natin malaman kailanman ang mga trasendental na katotohanan tungkol sa kaluluwa, ngunit tiyak na malalaman natin ang sansinukob na ating tinitirhan.
Dito mas mahalaga kaysa sa inaakala natin ang Katolikong intelektuwal na tradisyon Ang pahayag ay hindi na pinapalitan ng Diyos ang paliwanag. Ito ay na hindi nakikipagtagisan ang Diyos sa mga pangalawang sanhi. Pinapayagan ang mundo na maging tunay na sanhi-bunga. Nasusunog ang apoy dahil sa apoy. Bumabagsak ang mga katawan dahil sa gravity. Tumutubo ang mga binhi ayon sa kanilang kalikasan. Hindi ito mga nakatagong pagbabago ng kalooban ng Diyos. Mga matatag na pattern ang mga ito sa nilikha.
Mula sa pananaw na iyon, ang tanyag na pag-usbong ng maagang scientific na pag-iisip noong medyebal at maagang modernong Europa ay hindi isang aksidenteng lumulutang sa ibabaw ng sibilisasyong Kristiyano. Malalim itong nakaugnay sa palagay na ang kalikasan ay hindi magulo sa antas ng kahulugan. Kahit marahas o misteryoso ang kalikasan, hindi ito basta-basta lang.
At binabago nito kung paano ka kumilos tungo sa mundo. Tumitigil kang makipagnegosasyon sa bawat penomenon na para bang may nakatagong personalidad ito. Nagsisimula kang magtanong kung ano ang palagi nitong ginagawa. Nagsisimula kang ihiwalay ang mga variable. Nagsisimula kang umasa na ang parehong kondisyon ay nagbubunga ng parehong resulta hindi dahil napayapa mo ang tamang espiritu, kundi dahil ang realidad ay nakaayos sa paraang nauunawaan sa pagsisiyasat. Wala sa mga ito ang nangangahulugang “inimbento” ng Katolisismo ang agham sa ganap na kahulugan, kundi sa halip ay naglagay ng balangkas para umunlad ang Agham nang ganoong kalaki. Oo, gamit ang pilosopiyang Griyego at mga pananaw nito, mga numerong Indian at iba pang teknik mula sa iba pang bahagi ng mundo. Ang agham bilang pamamaraan ay isang mahaba, maramihang-sibilisasyon na pag-unlad. Ngunit may natatanging ginawa ang Katolikong monoteismo: tumulong itong alisin ang isang partikular na uri ng metapisikal na pagkabalisa tungkol sa kalikasan. Ginawa nitong hindi gaanong parang matao na negosasyon ng mga kalooban ang mundo at mas parang isang pinag-isang kaayusang maaaring matiyagang pag-aralan.